Helixio, prestataire de services DNA-seq
En tant que prestataire de services NGS, Helixio propose des services DNA-seq assurés sur la plateforme Illumina, depuis la préparation des échantillons jusqu’à l’analyse de données générées par le séquençage.
Séquençage de génome complet
Le séquençage de génome complet (Whole-genome sequencing, WGS) est une méthode qui permet le reséquençage du génome de n’importe quel organisme. Il permet d’identifier des variations entre les librairies et le génome de référence, comme des polymorphismes, des courtes insertions/délétions ou de plus grands réarrangements (CNVs, translocations…). Pour les organismes sans référence connue et publiée, un assemblage de novo est approprié. Ce nouveau génome ainsi mis en évidence peut être annoté par homologie de séquences ou en fonction de bases de données pertinentes.
Séquençage ciblé
L’enrichissement de cible (Target enrichment, préparation de librairie et capture) permet de mettre le l’accent sur des gènes ou des régions d’intérêt. Les avantages du reséquençage ciblé par rapport à un séquençage génome complet sont :
- Une méthode moins couteuse ;
- Un séquençage profond pour les variants rares ;
- Des données plus faciles à exploiter ;
- Le séquençage des régions impliquées dans votre projet uniquement.
Les analyses ciblées comprennent l’analyse d’exome (génome codant pour les protéines) et l’enrichissement ciblé personnalisé (SureSelect enrichment probes, Agilent). Nos compétences permettent de coordonner le processus complet de design custom, depuis la liste de gènes d’intérêt jusqu’à la commande finale.
Nous proposons une large gamme de protocoles, en fonction du matériel de départ, et des solutions standard ou sur-mesure à mettre en place pour l’analyse de données DNA-seq. N’hésitez pas à visiter notre page dédiée à l’analyse bioinformatique !