Analyse personnalisée et sur-mesure
En tant que prestataire de services, Helixio propose des workflows personnalisés. Notre équipe développe des solutions personnalisées, comme:
- Un design microarray spécifique pour l’étude de profils d’expression ou CGH ;
- Un design de librairie NGS pour l’enrichissement ciblé ;
- Un design de sondes et primers qPCR.
Ces designs sur-mesure permettent l’étude de régions ciblées ou de génomes spécifiques. Nos compétences nous permettent de coordonner le processus complet, depuis une liste de gènes d’intérêt jusqu’à la commande du design final.
Étude de profils d’expression
Les technologies microarrays, qPCR et RNA-seq permettent l’étude de profils d’expression. Helixio vous guide dans le choix de la meilleure solution afin de répondre au mieux aux besoins et spécificités de votre projet.
Les microarrays expression assurent une couverture de l’ensemble des gènes et transcrits annotés. Une large gamme est disponible, avec différentes résolutions et pour une grande variété d’espèces. Un microarray spécifique peut également être conçu pour les génomes non disponibles au catalogue ou pour les projets spécifiques. Les microarrays expression peuvent être utilisés pour identifier les gènes dont l’expression varie en réponse à un paramètre expérimental ou pour valider une signature moléculaire.
La PCR quantitative, ou qPCR, est une technique de biologie moléculaire basée sur la PCR qui permet de détecter et quantifier l’expression des gènes. Helixio vous propose des services de qPCR et RT-qPCR basés sur la technologie TaqMan. Les essais TaqMan inventoriés et sur commande peuvent être utilisés pour votre projet. Nous pouvons également dessiner des sondes spécifiques à votre étude.
Méthylation
La méthylation est la modification épigénétique la plus connue ; elle peut entraîner l’inactivation d’un gène. Les îlots CpG sont riches en dinucléotides GC. Ils sont généralement non méthylés chez les mammifères et sont associés au développement. Les modifications de statut de méthylation sont souvent associées à des maladies.
Helixio propose des services en épigénétique, avec les microarrays Illumina. Nous adaptons nos offres en fonction de vos besoins.
Métagénomique
La métagénomique permet d'étudier la diversité de la population microbienne à partir d'échantillons humains ou environnementaux complexes. Helixio propose des service permettant une étude ciblée (gène 16S chez les procaryotes, régions ITS chez les champignons) ou une analyse des génomes complets (séquençage shotgun). L'analyde de données de métagénomique inclut l'assignation taxonomique, estimation de l'abondance, l'annotation fonctionnelle.
CGH
La technologie CGH array est une technique cytogénétique de haute résolution, utilisée pour l’identification d’aberrations chromosomiques. Helixio propose des services standard et sur-mesure avec les microarrays Agilent. L’approche standardisée est employée pour la plupart des espèces communes, avec différents formats (jusqu’à un million de sondes). L’approche sur-mesure est appliquée pour les espèces non disponibles au catalogue ou pour l’étude de régions ciblées.